sheller asp/asp.net/php/perl şeklinde hepsi mevcut %100 korunmak çok mümkün olmasada büyük oranda önüne geçebilirsiniz.
windows serverınızda antivirus yazılımı bulundurmanız %80 koruma sağlar.Diğer kalan %20 ise sistem ayarlamanız ile ilgilidir. clamav kurabilirsiniz yada avg business sürümü v.b .