Bu işi meta ile yapmak istiyorsan, hangi sayfa indekslenmesin istiyorsan meta'ya ekleyin
<meta name="robots" content="nofollow">
Robots.txt ile yapmak istiyorsan. Sitenin root'una robots.txt dosyası oluştur. Yani domain.com/robots.txt yazınca dosyayı görebil.
User-agent: *
Disallow: /folder1/...